Почему организм считают самостоятельной дискретной единицей биосферы?

Для простоты.

Можно рассматривать не организм, а симбиоз. Или вовсе био-геоценоз.

Можно рассматривать на уровне органов, клеток.

Но на уровне организма проще. Функции, значимые для решения проблем биосферы, локализуются как правило на уровне организма. Или во всяком случае проще формализуются.