Всегда ли преобразование идут природе на пользу

Нет, не всегда.

Например, застройка домов. Ведь этим "преобразуют" город. Но все эти строительные работы принесут вред природе, особенно, если под застройку ушёл хороший участок с растениями/деревьями и т. д. Т. к. всё это уничтожат, дабы построить дом.

Аналогичные примеры с какими-либо хим. заводами, которые выбросами химикатов загрязняют воздух/водоёмы.