Объясните, есть ли различия между живой и неживой природой на атомном уравне

Нет. Весь мир состоит из протонов нейтронов и электронов. Именно по этому возникла такая наука как Информатика.

Использование двоичных кодов её основа

Всё просто:

електрон=1

протон=0

нейтронов=нейтральный и не имеет смысла в информатике

Комбинируя количество данных можно получить любой химический элемент, или результат программирования.