Почему Пугачев так жестоко расправился с капитаном Мироновым и его женой, но пощадил Гринева?

Потому что Гринев был милостив к Пугачеву, когда тот еще не был"великим самозванцем". Он убил семью Маши, т. к. он убивал всех главнокомандующих городов, в данном случае городничих. Может если у него и была к ним жалость, он должен был их убить, хотя бы из-за своего статуса в кругу мятежников.