В чем нравственное превосходство Мери над Печориным?

Нет никакого "нравственного" превосходства княжны Мэри над Печориным - оба они дети своего времени и заложники светских правил игры. Просто Печорин умнее, циничнее и опытнее Мэри (у которой, возможно, ещё всё впереди), поэтому в светских интригах он легко переигрывает её и начинает манипулировать.