Проверочное со словом прекратить

Смотря где.

Если вы имеете ввиду прекрАтить, то скорее всего проверочное слово-краткий. Потому что его значение можно понимать как "сделать короче (остановив это) ". Для сравнения можно сопоставить с глаголом-антонимом "продолжать", однокоренным прилагательному "долгий".