1) Связаны ли между собой фонетика и орфография? А фонетика и орфоэпия? Покажите на примерах.

Конечно, все разделы русского языка связаны между собой. Например, правописание приставки БЕЗ-БЕС, только владея знаниями фонетики, мы правильно напишем - без пишется, если корень начинается со звонкого звука - беЗДельник, бес-с глухого-беСПокоить. Фонетика с орфоэпией также связаны. Например, очень известный пример: в заимствованных словах перед Е, согласно фонетике, мы можем произносить согласный и твердо и мягко, а орфоэпия уже решает, в каких случаях, как произносим. В слове темп - [тэмп] - твёрдо, музей [муз'эй] - мягко