Объясните знаки препинания в предложениях:

Гроза в коротких слабеющих вспышках освещала двухэтажное строение уже издалека, и промытый, пропущенный через ее чистилище воздух был свеж и резок. Стали слышаться привычные успокаивающие звуки: скрипело дерево, где-то тихонько журчала вода и гудок катера тихо-тихо прорезался от реки.

Первая запятая служит границей двух грамматических основ, - "гроза освещала" и "воздух был свеж и резок" - вторая соединяет два вроде как однородных определения слова "воздух" (промытый, пропущенный). Если они неоднородны, считайте, что это авторский знак. Но это к слову.

Двоеточие во втором предложении стоит потому, что последующие содержащей этот знак грамматической основе предложения не связаны с ней союзом; к тому же оно (двоеточие) как бы поясняет основу "стали слышаться привычные успокаивающие звуки" идущими далее основами, раскрывает её. Последняя запятая разделяет основу "скрипело дерево" с двумя последующими. А между ними ("журчала вода" и "гудок прорезался") запятая отсутствует по причине того, что они обе относятся к наречию "где-то" (можно вот так: где-то журчала вода и где-то гудок прорезался).

[Гроза в коротких слабеющих вспышках освещала двухэтажное строение уже издалека],1 и [промытый, 2 пропущенный через ее чистилищевоздухбыл свежирезок].

[ - ═], и [O, O - ═ и ═].

1 - запятая между простыми предложениями в сложносочиненном, связанными одиночным соед. союзом И.

2 - запятая между однородными определениями с бессоюзной связью.

Второй одиночный союз И связывает другой ряд однородных членов (сказуемых) - запятая не нужна.

___

[Стали слышаться привычные успокаивающие звуки]:1 [скрипелодерево],2 [где-то тихонько журчала вода] и [гудок катера тихо-тихо прорезался от реки].

[═ - ]: [═ - ], [═ - ] и [ - ═].

Сложное предложение с бессоюзной и сочинительной связью.

1 - двоеточие между простыми предложениями, связанными бессоюзной связью ( = а именно; пояснение).

2 - запятая между простыми предложениями, связанными бессоюзной связью (одномоментность действий, перечисление).

Одиночный соед. союз И связывает простые предложения, которые имеют общий член предл. (обстоятельство где-то) - запятая не нужна.